Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GRAMD1AQ96CP6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRAMD1AQ96CP6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms