Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRC59Q96AG4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRC59Q96AG4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LRRC59Q96AG4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
LRRC59Q96AG4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
LRRC59Q96AG4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LRRC59Q96AG4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
LRRC59Q96AG4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
LRRC59Q96AG4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35■■■■□ 3.19
LRRC59Q96AG4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LRRC59Q96AG4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRC59Q96AG4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRC59Q96AG4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRC59Q96AG4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRC59Q96AG4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRC59Q96AG4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LRRC59Q96AG4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
LRRC59Q96AG4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
LRRC59Q96AG4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
LRRC59Q96AG4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
LRRC59Q96AG4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
LRRC59Q96AG4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
LRRC59Q96AG4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
LRRC59Q96AG4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRC59Q96AG4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRC59Q96AG4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRC59Q96AG4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRC59Q96AG4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRC59Q96AG4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRC59Q96AG4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRC59Q96AG4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRC59Q96AG4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRC59Q96AG4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRC59Q96AG4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRC59Q96AG4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRC59Q96AG4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRC59Q96AG4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRC59Q96AG4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LRRC59Q96AG4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.77■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LRRC59Q96AG4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
LRRC59Q96AG4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LRRC59Q96AG4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LRRC59Q96AG4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
LRRC59Q96AG4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
LRRC59Q96AG4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LRRC59Q96AG4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
LRRC59Q96AG4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LRRC59Q96AG4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LRRC59Q96AG4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRC59Q96AG4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRC59Q96AG4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms