Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI22

MCFD2, Multiple coagulation factor deficiency protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCFD2Q8NI22 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCFD2Q8NI22 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCFD2Q8NI22 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCFD2Q8NI22 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms