Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYRIPQ8NFW9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYRIPQ8NFW9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms