Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NINQ8N4C6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NINQ8N4C6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms