Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
KRT28Q7Z3Y7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
KRT28Q7Z3Y7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
KRT28Q7Z3Y7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
KRT28Q7Z3Y7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KRT28Q7Z3Y7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KRT28Q7Z3Y7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
KRT28Q7Z3Y7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
KRT28Q7Z3Y7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
KRT28Q7Z3Y7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
KRT28Q7Z3Y7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
KRT28Q7Z3Y7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
KRT28Q7Z3Y7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
KRT28Q7Z3Y7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
KRT28Q7Z3Y7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
KRT28Q7Z3Y7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
KRT28Q7Z3Y7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
KRT28Q7Z3Y7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
KRT28Q7Z3Y7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KRT28Q7Z3Y7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
KRT28Q7Z3Y7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
KRT28Q7Z3Y7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KRT28Q7Z3Y7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
KRT28Q7Z3Y7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
KRT28Q7Z3Y7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KRT28Q7Z3Y7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
KRT28Q7Z3Y7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
KRT28Q7Z3Y7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KRT28Q7Z3Y7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
KRT28Q7Z3Y7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
KRT28Q7Z3Y7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
KRT28Q7Z3Y7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
KRT28Q7Z3Y7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
KRT28Q7Z3Y7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
KRT28Q7Z3Y7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
KRT28Q7Z3Y7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KRT28Q7Z3Y7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KRT28Q7Z3Y7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KRT28Q7Z3Y7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KRT28Q7Z3Y7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KRT28Q7Z3Y7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KRT28Q7Z3Y7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
KRT28Q7Z3Y7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KRT28Q7Z3Y7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
KRT28Q7Z3Y7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KRT28Q7Z3Y7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
KRT28Q7Z3Y7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KRT28Q7Z3Y7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KRT28Q7Z3Y7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KRT28Q7Z3Y7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KRT28Q7Z3Y7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KRT28Q7Z3Y7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KRT28Q7Z3Y7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KRT28Q7Z3Y7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
KRT28Q7Z3Y7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KRT28Q7Z3Y7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
KRT28Q7Z3Y7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
KRT28Q7Z3Y7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KRT28Q7Z3Y7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KRT28Q7Z3Y7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KRT28Q7Z3Y7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KRT28Q7Z3Y7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KRT28Q7Z3Y7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KRT28Q7Z3Y7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KRT28Q7Z3Y7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
KRT28Q7Z3Y7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms