Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT3

SSX9, Protein SSX9, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX9Q7RTT3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX9Q7RTT3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX9Q7RTT3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX9Q7RTT3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX9Q7RTT3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX9Q7RTT3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX9Q7RTT3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX9Q7RTT3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX9Q7RTT3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX9Q7RTT3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms