Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP9Q7RTR0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP9Q7RTR0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP9Q7RTR0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms