Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
TMUB2Q71RG4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMUB2Q71RG4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms