Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC00173Q6ZV60 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00173Q6ZV60 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00173Q6ZV60 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms