Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00299Q6ZSB3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00299Q6ZSB3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms