Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM136Q6ZRR5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM136Q6ZRR5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms