Protein–RNA interactions for Protein: Q6UUV7

CRTC3, CREB-regulated transcription coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTC3Q6UUV7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRTC3Q6UUV7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRTC3Q6UUV7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTC3Q6UUV7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTC3Q6UUV7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTC3Q6UUV7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTC3Q6UUV7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTC3Q6UUV7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTC3Q6UUV7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTC3Q6UUV7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTC3Q6UUV7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTC3Q6UUV7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTC3Q6UUV7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTC3Q6UUV7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTC3Q6UUV7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTC3Q6UUV7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTC3Q6UUV7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTC3Q6UUV7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms