Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZB4

C9orf50, Uncharacterized protein C9orf50, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50Q5SZB4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
C9orf50Q5SZB4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C9orf50Q5SZB4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf50Q5SZB4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.56■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.53■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf50Q5SZB4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms