Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
SNAPC4Q5SXM2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
SNAPC4Q5SXM2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
SNAPC4Q5SXM2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
SNAPC4Q5SXM2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
SNAPC4Q5SXM2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
SNAPC4Q5SXM2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
SNAPC4Q5SXM2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
SNAPC4Q5SXM2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
SNAPC4Q5SXM2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
SNAPC4Q5SXM2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
SNAPC4Q5SXM2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
SNAPC4Q5SXM2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
SNAPC4Q5SXM2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
SNAPC4Q5SXM2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
SNAPC4Q5SXM2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
SNAPC4Q5SXM2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
SNAPC4Q5SXM2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
SNAPC4Q5SXM2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
SNAPC4Q5SXM2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
SNAPC4Q5SXM2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
SNAPC4Q5SXM2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
SNAPC4Q5SXM2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC42.25■■■■■ 4.35
SNAPC4Q5SXM2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
SNAPC4Q5SXM2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
SNAPC4Q5SXM2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
SNAPC4Q5SXM2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
SNAPC4Q5SXM2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
SNAPC4Q5SXM2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
SNAPC4Q5SXM2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC42.2■■■■■ 4.35
SNAPC4Q5SXM2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
SNAPC4Q5SXM2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
SNAPC4Q5SXM2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
SNAPC4Q5SXM2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SNAPC4Q5SXM2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
SNAPC4Q5SXM2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
SNAPC4Q5SXM2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC42.11■■■■■ 4.33
SNAPC4Q5SXM2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
SNAPC4Q5SXM2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
SNAPC4Q5SXM2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SNAPC4Q5SXM2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SNAPC4Q5SXM2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SNAPC4Q5SXM2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SNAPC4Q5SXM2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SNAPC4Q5SXM2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SNAPC4Q5SXM2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
SNAPC4Q5SXM2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
SNAPC4Q5SXM2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
SNAPC4Q5SXM2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
SNAPC4Q5SXM2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
SNAPC4Q5SXM2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
SNAPC4Q5SXM2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SNAPC4Q5SXM2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SNAPC4Q5SXM2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SNAPC4Q5SXM2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
SNAPC4Q5SXM2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
SNAPC4Q5SXM2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
SNAPC4Q5SXM2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
SNAPC4Q5SXM2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
SNAPC4Q5SXM2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
SNAPC4Q5SXM2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
SNAPC4Q5SXM2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
SNAPC4Q5SXM2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SNAPC4Q5SXM2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
SNAPC4Q5SXM2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
SNAPC4Q5SXM2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
SNAPC4Q5SXM2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SNAPC4Q5SXM2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
SNAPC4Q5SXM2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
SNAPC4Q5SXM2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
SNAPC4Q5SXM2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
SNAPC4Q5SXM2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
SNAPC4Q5SXM2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
SNAPC4Q5SXM2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
SNAPC4Q5SXM2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.98■■■■■ 4.31
SNAPC4Q5SXM2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
SNAPC4Q5SXM2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
SNAPC4Q5SXM2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
SNAPC4Q5SXM2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
SNAPC4Q5SXM2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms