Protein–RNA interactions for Protein: Q5PR19

Putative UPF0607 protein LOC392364, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5PR19 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Q5PR19 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q5PR19 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q5PR19 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q5PR19 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Q5PR19 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q5PR19 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q5PR19 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q5PR19 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q5PR19 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q5PR19 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q5PR19 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q5PR19 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q5PR19 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q5PR19 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q5PR19 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q5PR19 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q5PR19 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q5PR19 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q5PR19 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q5PR19 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q5PR19 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q5PR19 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q5PR19 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q5PR19 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q5PR19 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q5PR19 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q5PR19 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q5PR19 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q5PR19 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q5PR19 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q5PR19 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q5PR19 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q5PR19 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q5PR19 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Q5PR19 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q5PR19 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q5PR19 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q5PR19 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q5PR19 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q5PR19 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q5PR19 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q5PR19 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q5PR19 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q5PR19 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q5PR19 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q5PR19 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q5PR19 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q5PR19 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q5PR19 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q5PR19 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q5PR19 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q5PR19 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q5PR19 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q5PR19 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q5PR19 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q5PR19 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q5PR19 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q5PR19 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q5PR19 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q5PR19 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q5PR19 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q5PR19 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q5PR19 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q5PR19 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q5PR19 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q5PR19 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q5PR19 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q5PR19 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Q5PR19 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q5PR19 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q5PR19 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Q5PR19 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q5PR19 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Q5PR19 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q5PR19 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q5PR19 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Q5PR19 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q5PR19 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Q5PR19 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q5PR19 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q5PR19 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q5PR19 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q5PR19 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q5PR19 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q5PR19 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q5PR19 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q5PR19 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q5PR19 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q5PR19 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q5PR19 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q5PR19 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q5PR19 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q5PR19 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q5PR19 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q5PR19 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q5PR19 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q5PR19 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q5PR19 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q5PR19 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms