Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KHDC3LQ587J8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
KHDC3LQ587J8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KHDC3LQ587J8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KHDC3LQ587J8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KHDC3LQ587J8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KHDC3LQ587J8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KHDC3LQ587J8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KHDC3LQ587J8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KHDC3LQ587J8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KHDC3LQ587J8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KHDC3LQ587J8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KHDC3LQ587J8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KHDC3LQ587J8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KHDC3LQ587J8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KHDC3LQ587J8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KHDC3LQ587J8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KHDC3LQ587J8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KHDC3LQ587J8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms