Protein–RNA interactions for Protein: Q53T59

HS1BP3, HCLS1-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS1BP3Q53T59 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HS1BP3Q53T59 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HS1BP3Q53T59 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HS1BP3Q53T59 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HS1BP3Q53T59 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HS1BP3Q53T59 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HS1BP3Q53T59 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HS1BP3Q53T59 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HS1BP3Q53T59 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HS1BP3Q53T59 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HS1BP3Q53T59 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HS1BP3Q53T59 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HS1BP3Q53T59 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HS1BP3Q53T59 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HS1BP3Q53T59 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HS1BP3Q53T59 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HS1BP3Q53T59 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HS1BP3Q53T59 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HS1BP3Q53T59 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HS1BP3Q53T59 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HS1BP3Q53T59 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HS1BP3Q53T59 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HS1BP3Q53T59 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HS1BP3Q53T59 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HS1BP3Q53T59 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HS1BP3Q53T59 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HS1BP3Q53T59 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HS1BP3Q53T59 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HS1BP3Q53T59 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HS1BP3Q53T59 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HS1BP3Q53T59 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HS1BP3Q53T59 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HS1BP3Q53T59 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HS1BP3Q53T59 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HS1BP3Q53T59 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HS1BP3Q53T59 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HS1BP3Q53T59 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HS1BP3Q53T59 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HS1BP3Q53T59 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HS1BP3Q53T59 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HS1BP3Q53T59 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HS1BP3Q53T59 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HS1BP3Q53T59 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HS1BP3Q53T59 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HS1BP3Q53T59 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HS1BP3Q53T59 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HS1BP3Q53T59 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HS1BP3Q53T59 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HS1BP3Q53T59 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HS1BP3Q53T59 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HS1BP3Q53T59 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HS1BP3Q53T59 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HS1BP3Q53T59 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HS1BP3Q53T59 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HS1BP3Q53T59 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HS1BP3Q53T59 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HS1BP3Q53T59 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HS1BP3Q53T59 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HS1BP3Q53T59 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HS1BP3Q53T59 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms