Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP13A4Q4VNC1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP13A4Q4VNC1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP13A4Q4VNC1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP13A4Q4VNC1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP13A4Q4VNC1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP13A4Q4VNC1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP13A4Q4VNC1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238 ms