Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1EQ15878 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1EQ15878 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA1EQ15878 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1EQ15878 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms