Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USF2Q15853 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USF2Q15853 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USF2Q15853 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USF2Q15853 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USF2Q15853 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USF2Q15853 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USF2Q15853 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USF2Q15853 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USF2Q15853 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USF2Q15853 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USF2Q15853 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USF2Q15853 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USF2Q15853 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USF2Q15853 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USF2Q15853 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USF2Q15853 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USF2Q15853 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USF2Q15853 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
USF2Q15853 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USF2Q15853 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
USF2Q15853 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USF2Q15853 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USF2Q15853 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USF2Q15853 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USF2Q15853 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USF2Q15853 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USF2Q15853 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USF2Q15853 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USF2Q15853 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USF2Q15853 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USF2Q15853 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USF2Q15853 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USF2Q15853 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USF2Q15853 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USF2Q15853 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USF2Q15853 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
USF2Q15853 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USF2Q15853 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USF2Q15853 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USF2Q15853 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USF2Q15853 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USF2Q15853 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USF2Q15853 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USF2Q15853 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USF2Q15853 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USF2Q15853 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USF2Q15853 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USF2Q15853 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USF2Q15853 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USF2Q15853 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USF2Q15853 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USF2Q15853 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USF2Q15853 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USF2Q15853 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USF2Q15853 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USF2Q15853 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USF2Q15853 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USF2Q15853 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
USF2Q15853 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USF2Q15853 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USF2Q15853 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USF2Q15853 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
USF2Q15853 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USF2Q15853 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USF2Q15853 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USF2Q15853 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USF2Q15853 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USF2Q15853 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USF2Q15853 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
USF2Q15853 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USF2Q15853 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USF2Q15853 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USF2Q15853 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USF2Q15853 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USF2Q15853 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USF2Q15853 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USF2Q15853 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USF2Q15853 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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