Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB30Q15771 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB30Q15771 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB30Q15771 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
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