Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF1CQ15572 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF1CQ15572 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF1CQ15572 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF1CQ15572 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF1CQ15572 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TAF1CQ15572 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF1CQ15572 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1CQ15572 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TAF1CQ15572 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
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