Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR6A1Q15406 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR6A1Q15406 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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