Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
R3HDM1Q15032 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
R3HDM1Q15032 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
R3HDM1Q15032 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
R3HDM1Q15032 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
R3HDM1Q15032 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
R3HDM1Q15032 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
R3HDM1Q15032 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
R3HDM1Q15032 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
R3HDM1Q15032 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
R3HDM1Q15032 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
R3HDM1Q15032 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
R3HDM1Q15032 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
R3HDM1Q15032 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
R3HDM1Q15032 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
R3HDM1Q15032 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
R3HDM1Q15032 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
R3HDM1Q15032 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
R3HDM1Q15032 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
R3HDM1Q15032 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
R3HDM1Q15032 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
R3HDM1Q15032 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
R3HDM1Q15032 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
R3HDM1Q15032 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
R3HDM1Q15032 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
R3HDM1Q15032 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
R3HDM1Q15032 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
R3HDM1Q15032 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
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