Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC2Q13868 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC2Q13868 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC2Q13868 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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