Protein–RNA interactions for Protein: Q13409

DYNC1I2, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I2Q13409 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DYNC1I2Q13409 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DYNC1I2Q13409 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DYNC1I2Q13409 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DYNC1I2Q13409 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DYNC1I2Q13409 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DYNC1I2Q13409 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DYNC1I2Q13409 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DYNC1I2Q13409 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DYNC1I2Q13409 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DYNC1I2Q13409 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DYNC1I2Q13409 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DYNC1I2Q13409 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DYNC1I2Q13409 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DYNC1I2Q13409 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms