Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNEQ04844 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNEQ04844 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNEQ04844 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms