Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
APBA1Q02410 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APBA1Q02410 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APBA1Q02410 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APBA1Q02410 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APBA1Q02410 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APBA1Q02410 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APBA1Q02410 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APBA1Q02410 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APBA1Q02410 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
APBA1Q02410 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APBA1Q02410 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APBA1Q02410 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APBA1Q02410 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APBA1Q02410 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APBA1Q02410 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APBA1Q02410 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms