Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPS35P82673 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS35P82673 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS35P82673 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.4 ms