Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCL23P55773 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCL23P55773 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCL23P55773 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCL23P55773 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCL23P55773 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCL23P55773 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCL23P55773 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCL23P55773 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCL23P55773 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCL23P55773 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCL23P55773 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCL23P55773 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCL23P55773 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCL23P55773 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCL23P55773 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCL23P55773 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCL23P55773 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCL23P55773 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCL23P55773 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCL23P55773 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCL23P55773 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCL23P55773 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCL23P55773 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCL23P55773 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCL23P55773 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCL23P55773 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCL23P55773 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCL23P55773 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCL23P55773 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCL23P55773 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCL23P55773 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCL23P55773 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCL23P55773 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCL23P55773 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCL23P55773 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCL23P55773 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCL23P55773 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCL23P55773 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCL23P55773 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCL23P55773 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCL23P55773 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCL23P55773 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCL23P55773 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCL23P55773 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCL23P55773 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCL23P55773 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCL23P55773 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCL23P55773 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCL23P55773 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCL23P55773 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCL23P55773 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCL23P55773 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCL23P55773 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCL23P55773 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCL23P55773 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCL23P55773 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCL23P55773 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCL23P55773 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCL23P55773 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCL23P55773 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCL23P55773 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCL23P55773 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCL23P55773 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCL23P55773 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCL23P55773 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCL23P55773 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCL23P55773 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCL23P55773 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCL23P55773 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCL23P55773 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCL23P55773 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCL23P55773 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCL23P55773 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCL23P55773 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCL23P55773 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCL23P55773 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCL23P55773 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCL23P55773 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCL23P55773 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCL23P55773 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCL23P55773 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCL23P55773 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCL23P55773 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCL23P55773 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCL23P55773 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCL23P55773 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCL23P55773 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCL23P55773 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCL23P55773 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCL23P55773 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCL23P55773 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCL23P55773 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCL23P55773 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCL23P55773 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCL23P55773 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCL23P55773 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCL23P55773 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCL23P55773 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCL23P55773 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms