Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KPNA2P52292 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA2P52292 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KPNA2P52292 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms