Protein–RNA interactions for Protein: P50748

KNTC1, Kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNTC1P50748 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KNTC1P50748 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KNTC1P50748 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.6 ms