Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARCN1P48444 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARCN1P48444 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARCN1P48444 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ARCN1P48444 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms