Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
KDM5AP29375 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
KDM5AP29375 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
KDM5AP29375 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
KDM5AP29375 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
KDM5AP29375 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
KDM5AP29375 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
KDM5AP29375 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
KDM5AP29375 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
KDM5AP29375 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
KDM5AP29375 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5AP29375 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5AP29375 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5AP29375 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
KDM5AP29375 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
KDM5AP29375 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
KDM5AP29375 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
KDM5AP29375 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM5AP29375 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM5AP29375 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM5AP29375 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM5AP29375 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM5AP29375 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5AP29375 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5AP29375 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5AP29375 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5AP29375 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
KDM5AP29375 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM5AP29375 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM5AP29375 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM5AP29375 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM5AP29375 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM5AP29375 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM5AP29375 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM5AP29375 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM5AP29375 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM5AP29375 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM5AP29375 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM5AP29375 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM5AP29375 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM5AP29375 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM5AP29375 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
KDM5AP29375 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
KDM5AP29375 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
KDM5AP29375 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5AP29375 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms