Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL3RAP26951 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.2 ms