Protein–RNA interactions for Protein: P25037

UBP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP1P25037 YHP1YDR451C 1062 nt9.36□□□□□ -0.91
UBP1P25037 RCF1YML030W 480 nt9.36□□□□□ -0.91
UBP1P25037 ODC1YPL134C 933 nt9.36□□□□□ -0.91
UBP1P25037 PUS7YOR243C 2031 nt9.36□□□□□ -0.91
UBP1P25037 OSM1YJR051W 1506 nt9.36□□□□□ -0.91
UBP1P25037 HXK1YFR053C 1458 nt9.35□□□□□ -0.91
UBP1P25037 HOC1YJR075W 1191 nt9.35□□□□□ -0.91
UBP1P25037 NAT5YOR253W 531 nt9.35□□□□□ -0.91
UBP1P25037 YBR056WYBR056W 1506 nt9.35□□□□□ -0.91
UBP1P25037 RRP43YCR035C 1185 nt9.34□□□□□ -0.91
UBP1P25037 YLR162WYLR162W 357 nt9.34□□□□□ -0.91
UBP1P25037 snR30snR30 606 nt9.34□□□□□ -0.91
UBP1P25037 PSA1YDL055C 1086 nt9.33□□□□□ -0.92
UBP1P25037 AGX1YFL030W 1158 nt9.33□□□□□ -0.92
UBP1P25037 CWP2YKL096W-A 279 nt9.33□□□□□ -0.92
UBP1P25037 PRY2YKR013W 990 nt9.33□□□□□ -0.92
UBP1P25037 YDR306CYDR306C 1437 nt9.32□□□□□ -0.92
UBP1P25037 PIL1YGR086C 1020 nt9.32□□□□□ -0.92
UBP1P25037 YML122CYML122C 381 nt9.32□□□□□ -0.92
UBP1P25037 AIM41YOR215C 558 nt9.32□□□□□ -0.92
UBP1P25037 EHT1YBR177C 1356 nt9.32□□□□□ -0.92
UBP1P25037 NFS1YCL017C 1494 nt9.32□□□□□ -0.92
UBP1P25037 ALD5YER073W 1563 nt9.32□□□□□ -0.92
UBP1P25037 COX15YER141W 1461 nt9.31□□□□□ -0.92
UBP1P25037 ATG22YCL038C 1587 nt9.31□□□□□ -0.92
UBP1P25037 NAF1YNL124W 1479 nt9.3□□□□□ -0.92
UBP1P25037 LSM12YHR121W 564 nt9.3□□□□□ -0.92
UBP1P25037 IMG1YCR046C 510 nt9.29□□□□□ -0.92
UBP1P25037 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt9.29□□□□□ -0.92
UBP1P25037 IDP3YNL009W 1263 nt9.29□□□□□ -0.92
UBP1P25037 PZF1YPR186C 1290 nt9.29□□□□□ -0.92
UBP1P25037 SSL2YIL143C 2532 nt9.29□□□□□ -0.92
UBP1P25037 MRPL35YDR322W 1104 nt9.28□□□□□ -0.92
UBP1P25037 DRE2YKR071C 1047 nt9.28□□□□□ -0.92
UBP1P25037 BNA3YJL060W 1335 nt9.28□□□□□ -0.92
UBP1P25037 GET2YER083C 858 nt9.27□□□□□ -0.93
UBP1P25037 DST1YGL043W 930 nt9.27□□□□□ -0.93
UBP1P25037 OPI1YHL020C 1215 nt9.27□□□□□ -0.93
UBP1P25037 MRS4YKR052C 915 nt9.27□□□□□ -0.93
UBP1P25037 LRO1YNR008W 1986 nt9.26□□□□□ -0.93
UBP1P25037 CPR2YHR057C 618 nt9.26□□□□□ -0.93
UBP1P25037 MDM35YKL053C-A 261 nt9.26□□□□□ -0.93
UBP1P25037 YOL046CYOL046C 675 nt9.26□□□□□ -0.93
UBP1P25037 STE3YKL178C 1413 nt9.25□□□□□ -0.93
UBP1P25037 PDA1YER178W 1263 nt9.25□□□□□ -0.93
UBP1P25037 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt9.25□□□□□ -0.93
UBP1P25037 INP54YOL065C 1155 nt9.25□□□□□ -0.93
UBP1P25037 SIR2YDL042C 1689 nt9.24□□□□□ -0.93
UBP1P25037 YDR467CYDR467C 327 nt9.24□□□□□ -0.93
UBP1P25037 YGR137WYGR137W 375 nt9.24□□□□□ -0.93
UBP1P25037 YOR200WYOR200W 399 nt9.24□□□□□ -0.93
UBP1P25037 MED6YHR058C 888 nt9.23□□□□□ -0.93
UBP1P25037 MRS3YJL133W 945 nt9.23□□□□□ -0.93
UBP1P25037 YRF1-2YER190W 5046 nt9.23□□□□□ -0.93
UBP1P25037 SSC1YJR045C 1965 nt9.23□□□□□ -0.93
UBP1P25037 DPL1YDR294C 1770 nt9.22□□□□□ -0.93
UBP1P25037 YNL295WYNL295W 1575 nt9.22□□□□□ -0.93
UBP1P25037 YPQ2YDR352W 954 nt9.22□□□□□ -0.93
UBP1P25037 DPM1YPR183W 804 nt9.22□□□□□ -0.93
UBP1P25037 YMC2YBR104W 990 nt9.22□□□□□ -0.93
UBP1P25037 PCL10YGL134W 1302 nt9.22□□□□□ -0.93
UBP1P25037 MNN9YPL050C 1188 nt9.21□□□□□ -0.94
UBP1P25037 YJL163CYJL163C 1668 nt9.2□□□□□ -0.94
UBP1P25037 DSC3YOR223W 879 nt9.2□□□□□ -0.94
UBP1P25037 SPS1YDR523C 1473 nt9.2□□□□□ -0.94
UBP1P25037 MRPL19YNL185C 477 nt9.19□□□□□ -0.94
UBP1P25037 YNL234WYNL234W 1281 nt9.19□□□□□ -0.94
UBP1P25037 YOR072WYOR072W 315 nt9.19□□□□□ -0.94
UBP1P25037 YPR076WYPR076W 375 nt9.19□□□□□ -0.94
UBP1P25037 YPT10YBR264C 600 nt9.19□□□□□ -0.94
UBP1P25037 TPN1YGL186C 1740 nt9.19□□□□□ -0.94
UBP1P25037 MPC1YGL080W 393 nt9.18□□□□□ -0.94
UBP1P25037 TUB1YML085C 1344 nt9.18□□□□□ -0.94
UBP1P25037 WSC3YOL105C 1671 nt9.17□□□□□ -0.94
UBP1P25037 HXT10YFL011W 1641 nt9.16□□□□□ -0.94
UBP1P25037 RBS1YDL189W 1374 nt9.16□□□□□ -0.94
UBP1P25037 AI3Q0060 1248 nt9.16□□□□□ -0.94
UBP1P25037 OCA1YNL099C 717 nt9.15□□□□□ -0.94
UBP1P25037 MRPL36YBR122C 534 nt9.15□□□□□ -0.94
UBP1P25037 MTO1YGL236C 2010 nt9.15□□□□□ -0.94
UBP1P25037 GAT1YFL021W 1533 nt9.15□□□□□ -0.95
UBP1P25037 ERR3YMR323W 1314 nt9.14□□□□□ -0.95
UBP1P25037 YML034C-AYML034C-A 399 nt9.14□□□□□ -0.95
UBP1P25037 ALR1YOL130W 2580 nt9.13□□□□□ -0.95
UBP1P25037 YCR049CYCR049C 447 nt9.13□□□□□ -0.95
UBP1P25037 PPH21YDL134C 1110 nt9.13□□□□□ -0.95
UBP1P25037 RRP1YDR087C 837 nt9.13□□□□□ -0.95
UBP1P25037 TAF4YMR005W 1167 nt9.13□□□□□ -0.95
UBP1P25037 YPL168WYPL168W 1293 nt9.13□□□□□ -0.95
UBP1P25037 ILV6YCL009C 930 nt9.13□□□□□ -0.95
UBP1P25037 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt9.12□□□□□ -0.95
UBP1P25037 YBL112CYBL112C 318 nt9.12□□□□□ -0.95
UBP1P25037 YCL049CYCL049C 939 nt9.12□□□□□ -0.95
UBP1P25037 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt9.11□□□□□ -0.95
UBP1P25037 YLR463CYLR463C 552 nt9.11□□□□□ -0.95
UBP1P25037 YPR150WYPR150W 522 nt9.11□□□□□ -0.95
UBP1P25037 SKP1YDR328C 585 nt9.1□□□□□ -0.95
UBP1P25037 YLR173WYLR173W 1827 nt9.1□□□□□ -0.95
UBP1P25037 INH1YDL181W 258 nt9.09□□□□□ -0.95
UBP1P25037 FIT2YOR382W 462 nt9.09□□□□□ -0.95
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