Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRR1P24046 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRR1P24046 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRR1P24046 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GABRR1P24046 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GABRR1P24046 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRR1P24046 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRR1P24046 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRR1P24046 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRR1P24046 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRR1P24046 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRR1P24046 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRR1P24046 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRR1P24046 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GABRR1P24046 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRR1P24046 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRR1P24046 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRR1P24046 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRR1P24046 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRR1P24046 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRR1P24046 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms