Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRBP23467 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRBP23467 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
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