Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C4BPBP20851 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C4BPBP20851 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BPBP20851 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms