Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CAPN2P17655 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CAPN2P17655 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPN2P17655 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPN2P17655 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms