Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA4P13612 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA4P13612 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA4P13612 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA4P13612 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA4P13612 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA4P13612 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA4P13612 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA4P13612 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA4P13612 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGA4P13612 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGA4P13612 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGA4P13612 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGA4P13612 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGA4P13612 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ITGA4P13612 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGA4P13612 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGA4P13612 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ITGA4P13612 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGA4P13612 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGA4P13612 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGA4P13612 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGA4P13612 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGA4P13612 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ITGA4P13612 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA4P13612 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA4P13612 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA4P13612 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA4P13612 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA4P13612 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA4P13612 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA4P13612 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA4P13612 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGA4P13612 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGA4P13612 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGA4P13612 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGA4P13612 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGA4P13612 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITGA4P13612 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITGA4P13612 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITGA4P13612 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA4P13612 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA4P13612 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA4P13612 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA4P13612 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA4P13612 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA4P13612 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGA4P13612 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGA4P13612 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms