Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX4

SMIM18, Small integral membrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM18P0DKX4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM18P0DKX4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMIM18P0DKX4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM18P0DKX4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM18P0DKX4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms