Protein–RNA interactions for Protein: P09486

SPARC, SPARC, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCP09486 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCP09486 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCP09486 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPARCP09486 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCP09486 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCP09486 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCP09486 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCP09486 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCP09486 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCP09486 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPARCP09486 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPARCP09486 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPARCP09486 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPARCP09486 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPARCP09486 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPARCP09486 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPARCP09486 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPARCP09486 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPARCP09486 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPARCP09486 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPARCP09486 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPARCP09486 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPARCP09486 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPARCP09486 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPARCP09486 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPARCP09486 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPARCP09486 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPARCP09486 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPARCP09486 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPARCP09486 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPARCP09486 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPARCP09486 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPARCP09486 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPARCP09486 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPARCP09486 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPARCP09486 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPARCP09486 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPARCP09486 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCP09486 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCP09486 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCP09486 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCP09486 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPARCP09486 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPARCP09486 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPARCP09486 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPARCP09486 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPARCP09486 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPARCP09486 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPARCP09486 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPARCP09486 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPARCP09486 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPARCP09486 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPARCP09486 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPARCP09486 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPARCP09486 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPARCP09486 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPARCP09486 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPARCP09486 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPARCP09486 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPARCP09486 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPARCP09486 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPARCP09486 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPARCP09486 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPARCP09486 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPARCP09486 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPARCP09486 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPARCP09486 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPARCP09486 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPARCP09486 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPARCP09486 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPARCP09486 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPARCP09486 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPARCP09486 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPARCP09486 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPARCP09486 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPARCP09486 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPARCP09486 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPARCP09486 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPARCP09486 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPARCP09486 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPARCP09486 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPARCP09486 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPARCP09486 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPARCP09486 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPARCP09486 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPARCP09486 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPARCP09486 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPARCP09486 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPARCP09486 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPARCP09486 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPARCP09486 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPARCP09486 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPARCP09486 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPARCP09486 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPARCP09486 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPARCP09486 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPARCP09486 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPARCP09486 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPARCP09486 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPARCP09486 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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