Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP3BO95985 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP3BO95985 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms