Protein–RNA interactions for Protein: O75783

RHBDL1, Rhomboid-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL1O75783 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDL1O75783 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDL1O75783 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDL1O75783 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL1O75783 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL1O75783 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL1O75783 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL1O75783 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL1O75783 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDL1O75783 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDL1O75783 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDL1O75783 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDL1O75783 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDL1O75783 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL1O75783 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL1O75783 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL1O75783 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL1O75783 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL1O75783 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDL1O75783 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDL1O75783 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDL1O75783 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDL1O75783 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDL1O75783 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL1O75783 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL1O75783 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL1O75783 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL1O75783 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL1O75783 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL1O75783 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL1O75783 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL1O75783 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL1O75783 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL1O75783 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL1O75783 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL1O75783 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms