Protein–RNA interactions for Protein: O75783

RHBDL1, Rhomboid-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL1O75783 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL1O75783 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDL1O75783 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDL1O75783 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDL1O75783 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL1O75783 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL1O75783 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL1O75783 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL1O75783 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL1O75783 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDL1O75783 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDL1O75783 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDL1O75783 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDL1O75783 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDL1O75783 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL1O75783 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL1O75783 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL1O75783 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL1O75783 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL1O75783 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL1O75783 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDL1O75783 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDL1O75783 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDL1O75783 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDL1O75783 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDL1O75783 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDL1O75783 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL1O75783 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL1O75783 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL1O75783 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL1O75783 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL1O75783 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL1O75783 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RHBDL1O75783 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL1O75783 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL1O75783 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL1O75783 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL1O75783 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL1O75783 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL1O75783 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms