Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD2O60548 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD2O60548 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms