Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKNO60260 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKNO60260 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKNO60260 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKNO60260 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKNO60260 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKNO60260 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKNO60260 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKNO60260 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKNO60260 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKNO60260 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKNO60260 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKNO60260 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKNO60260 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKNO60260 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKNO60260 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKNO60260 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRKNO60260 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKNO60260 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKNO60260 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKNO60260 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKNO60260 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKNO60260 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKNO60260 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKNO60260 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKNO60260 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKNO60260 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKNO60260 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKNO60260 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKNO60260 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKNO60260 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKNO60260 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKNO60260 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKNO60260 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKNO60260 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKNO60260 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKNO60260 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKNO60260 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKNO60260 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKNO60260 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKNO60260 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKNO60260 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKNO60260 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKNO60260 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKNO60260 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKNO60260 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKNO60260 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKNO60260 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKNO60260 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKNO60260 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKNO60260 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKNO60260 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKNO60260 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKNO60260 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKNO60260 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKNO60260 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKNO60260 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKNO60260 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKNO60260 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKNO60260 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKNO60260 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKNO60260 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKNO60260 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKNO60260 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKNO60260 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKNO60260 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKNO60260 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKNO60260 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKNO60260 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKNO60260 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKNO60260 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKNO60260 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKNO60260 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKNO60260 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKNO60260 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKNO60260 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKNO60260 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKNO60260 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKNO60260 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKNO60260 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKNO60260 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKNO60260 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKNO60260 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKNO60260 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKNO60260 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKNO60260 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKNO60260 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKNO60260 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKNO60260 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKNO60260 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKNO60260 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKNO60260 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKNO60260 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKNO60260 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKNO60260 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKNO60260 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKNO60260 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKNO60260 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKNO60260 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKNO60260 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms