Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC3O43617 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC3O43617 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC3O43617 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC3O43617 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC3O43617 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC3O43617 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC3O43617 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC3O43617 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC3O43617 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC3O43617 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC3O43617 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC3O43617 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC3O43617 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC3O43617 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3O43617 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms