Protein–RNA interactions for Protein: O43559

FRS3, Fibroblast growth factor receptor substrate 3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRS3O43559 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRS3O43559 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRS3O43559 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FRS3O43559 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRS3O43559 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRS3O43559 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRS3O43559 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRS3O43559 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRS3O43559 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRS3O43559 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FRS3O43559 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRS3O43559 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRS3O43559 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRS3O43559 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRS3O43559 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRS3O43559 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRS3O43559 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRS3O43559 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRS3O43559 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRS3O43559 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRS3O43559 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRS3O43559 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRS3O43559 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRS3O43559 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRS3O43559 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRS3O43559 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRS3O43559 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRS3O43559 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRS3O43559 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRS3O43559 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRS3O43559 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRS3O43559 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRS3O43559 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRS3O43559 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRS3O43559 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRS3O43559 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRS3O43559 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRS3O43559 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRS3O43559 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRS3O43559 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRS3O43559 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRS3O43559 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRS3O43559 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FRS3O43559 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRS3O43559 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRS3O43559 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRS3O43559 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRS3O43559 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRS3O43559 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FRS3O43559 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRS3O43559 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRS3O43559 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRS3O43559 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRS3O43559 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRS3O43559 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRS3O43559 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRS3O43559 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRS3O43559 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRS3O43559 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRS3O43559 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRS3O43559 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRS3O43559 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRS3O43559 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRS3O43559 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRS3O43559 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRS3O43559 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRS3O43559 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRS3O43559 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRS3O43559 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRS3O43559 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRS3O43559 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRS3O43559 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRS3O43559 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRS3O43559 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRS3O43559 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRS3O43559 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRS3O43559 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRS3O43559 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRS3O43559 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRS3O43559 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRS3O43559 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRS3O43559 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRS3O43559 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRS3O43559 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRS3O43559 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRS3O43559 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRS3O43559 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRS3O43559 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRS3O43559 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRS3O43559 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRS3O43559 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FRS3O43559 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FRS3O43559 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FRS3O43559 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRS3O43559 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FRS3O43559 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRS3O43559 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRS3O43559 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRS3O43559 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRS3O43559 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms